Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
NUP153P49790 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NUP153P49790 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NUP153P49790 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NUP153P49790 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NUP153P49790 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NUP153P49790 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NUP153P49790 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NUP153P49790 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NUP153P49790 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NUP153P49790 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NUP153P49790 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
NUP153P49790 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
NUP153P49790 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NUP153P49790 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
NUP153P49790 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NUP153P49790 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NUP153P49790 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NUP153P49790 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NUP153P49790 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
NUP153P49790 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NUP153P49790 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NUP153P49790 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NUP153P49790 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NUP153P49790 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NUP153P49790 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NUP153P49790 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NUP153P49790 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NUP153P49790 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NUP153P49790 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NUP153P49790 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NUP153P49790 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NUP153P49790 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NUP153P49790 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NUP153P49790 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NUP153P49790 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NUP153P49790 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NUP153P49790 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NUP153P49790 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NUP153P49790 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NUP153P49790 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NUP153P49790 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NUP153P49790 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NUP153P49790 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NUP153P49790 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NUP153P49790 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NUP153P49790 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NUP153P49790 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NUP153P49790 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NUP153P49790 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NUP153P49790 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NUP153P49790 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NUP153P49790 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NUP153P49790 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NUP153P49790 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NUP153P49790 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NUP153P49790 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NUP153P49790 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NUP153P49790 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NUP153P49790 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NUP153P49790 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NUP153P49790 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NUP153P49790 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NUP153P49790 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NUP153P49790 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NUP153P49790 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NUP153P49790 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
NUP153P49790 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NUP153P49790 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NUP153P49790 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NUP153P49790 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NUP153P49790 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NUP153P49790 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NUP153P49790 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NUP153P49790 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NUP153P49790 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NUP153P49790 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NUP153P49790 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
NUP153P49790 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NUP153P49790 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
NUP153P49790 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NUP153P49790 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NUP153P49790 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NUP153P49790 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NUP153P49790 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
NUP153P49790 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
NUP153P49790 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
NUP153P49790 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NUP153P49790 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
NUP153P49790 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
NUP153P49790 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
NUP153P49790 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NUP153P49790 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NUP153P49790 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NUP153P49790 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NUP153P49790 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NUP153P49790 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NUP153P49790 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NUP153P49790 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
NUP153P49790 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms