Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP4P49662 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP4P49662 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP4P49662 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP4P49662 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP4P49662 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP4P49662 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP4P49662 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP4P49662 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP4P49662 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP4P49662 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP4P49662 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP4P49662 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP4P49662 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP4P49662 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP4P49662 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP4P49662 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP4P49662 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP4P49662 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP4P49662 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP4P49662 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CASP4P49662 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CASP4P49662 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP4P49662 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP4P49662 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP4P49662 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP4P49662 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP4P49662 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP4P49662 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP4P49662 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP4P49662 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP4P49662 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP4P49662 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP4P49662 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP4P49662 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP4P49662 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP4P49662 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP4P49662 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP4P49662 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP4P49662 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP4P49662 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP4P49662 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP4P49662 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP4P49662 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP4P49662 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP4P49662 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP4P49662 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP4P49662 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP4P49662 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP4P49662 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP4P49662 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP4P49662 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP4P49662 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP4P49662 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP4P49662 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP4P49662 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP4P49662 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP4P49662 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP4P49662 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP4P49662 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP4P49662 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP4P49662 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP4P49662 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP4P49662 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP4P49662 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP4P49662 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP4P49662 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP4P49662 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP4P49662 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP4P49662 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP4P49662 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP4P49662 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP4P49662 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP4P49662 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP4P49662 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP4P49662 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP4P49662 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP4P49662 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP4P49662 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP4P49662 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP4P49662 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP4P49662 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP4P49662 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP4P49662 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP4P49662 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP4P49662 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP4P49662 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP4P49662 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP4P49662 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP4P49662 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP4P49662 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP4P49662 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP4P49662 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP4P49662 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP4P49662 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP4P49662 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP4P49662 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP4P49662 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP4P49662 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP4P49662 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms