Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms