Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AMPHP49418 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AMPHP49418 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AMPHP49418 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AMPHP49418 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
AMPHP49418 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
AMPHP49418 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
AMPHP49418 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
AMPHP49418 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AMPHP49418 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AMPHP49418 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
AMPHP49418 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AMPHP49418 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
AMPHP49418 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
AMPHP49418 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
AMPHP49418 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
AMPHP49418 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
AMPHP49418 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AMPHP49418 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AMPHP49418 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AMPHP49418 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AMPHP49418 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AMPHP49418 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AMPHP49418 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AMPHP49418 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AMPHP49418 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AMPHP49418 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AMPHP49418 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AMPHP49418 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AMPHP49418 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AMPHP49418 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AMPHP49418 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
AMPHP49418 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AMPHP49418 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
AMPHP49418 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AMPHP49418 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
AMPHP49418 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AMPHP49418 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AMPHP49418 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AMPHP49418 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AMPHP49418 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AMPHP49418 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AMPHP49418 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
AMPHP49418 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.55■■■□□ 2
AMPHP49418 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
AMPHP49418 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
AMPHP49418 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
AMPHP49418 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AMPHP49418 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.55■■■□□ 2
AMPHP49418 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AMPHP49418 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
AMPHP49418 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AMPHP49418 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AMPHP49418 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
AMPHP49418 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AMPHP49418 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
AMPHP49418 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
AMPHP49418 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AMPHP49418 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AMPHP49418 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
AMPHP49418 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
AMPHP49418 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
AMPHP49418 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
AMPHP49418 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AMPHP49418 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AMPHP49418 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AMPHP49418 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AMPHP49418 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
AMPHP49418 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
AMPHP49418 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
AMPHP49418 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
AMPHP49418 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AMPHP49418 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.53■■■□□ 2
AMPHP49418 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AMPHP49418 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AMPHP49418 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
AMPHP49418 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AMPHP49418 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
AMPHP49418 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.52■■■□□ 2
AMPHP49418 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
AMPHP49418 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
AMPHP49418 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
AMPHP49418 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
AMPHP49418 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AMPHP49418 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AMPHP49418 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
AMPHP49418 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AMPHP49418 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AMPHP49418 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AMPHP49418 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AMPHP49418 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AMPHP49418 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AMPHP49418 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AMPHP49418 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AMPHP49418 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AMPHP49418 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AMPHP49418 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AMPHP49418 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AMPHP49418 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
AMPHP49418 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms