Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms