Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME1P48163 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME1P48163 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME1P48163 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME1P48163 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME1P48163 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME1P48163 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME1P48163 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ME1P48163 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME1P48163 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME1P48163 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME1P48163 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME1P48163 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME1P48163 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME1P48163 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME1P48163 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME1P48163 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME1P48163 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME1P48163 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME1P48163 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME1P48163 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME1P48163 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME1P48163 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME1P48163 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME1P48163 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME1P48163 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME1P48163 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ME1P48163 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME1P48163 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME1P48163 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME1P48163 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME1P48163 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME1P48163 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME1P48163 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME1P48163 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME1P48163 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME1P48163 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME1P48163 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME1P48163 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME1P48163 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME1P48163 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME1P48163 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME1P48163 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME1P48163 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME1P48163 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME1P48163 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ME1P48163 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME1P48163 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME1P48163 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME1P48163 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME1P48163 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME1P48163 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME1P48163 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME1P48163 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME1P48163 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME1P48163 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ME1P48163 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME1P48163 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ME1P48163 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ME1P48163 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ME1P48163 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ME1P48163 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ME1P48163 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ME1P48163 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ME1P48163 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ME1P48163 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ME1P48163 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ME1P48163 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ME1P48163 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ME1P48163 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ME1P48163 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ME1P48163 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ME1P48163 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ME1P48163 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ME1P48163 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ME1P48163 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ME1P48163 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ME1P48163 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ME1P48163 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ME1P48163 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ME1P48163 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ME1P48163 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ME1P48163 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ME1P48163 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ME1P48163 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ME1P48163 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ME1P48163 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ME1P48163 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ME1P48163 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ME1P48163 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ME1P48163 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ME1P48163 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ME1P48163 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ME1P48163 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ME1P48163 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ME1P48163 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ME1P48163 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ME1P48163 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ME1P48163 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ME1P48163 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms