Protein–RNA interactions for Protein: P47042

IKS1, Probable serine/threonine-protein kinase IKS1, yeastyeast

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
IKS1P47042 SPC1YJR010C-A 285 nt2.65□□□□□ -1.99
IKS1P47042 LSM8YJR022W 330 nt2.65□□□□□ -1.99
IKS1P47042 YAL037WYAL037W 804 nt2.65□□□□□ -1.99
IKS1P47042 YLR101CYLR101C 396 nt2.65□□□□□ -1.99
IKS1P47042 SMA2YML066C 1110 nt2.65□□□□□ -1.99
IKS1P47042 OST2YOR103C 393 nt2.65□□□□□ -1.99
IKS1P47042 RRD2YPL152W 1077 nt2.65□□□□□ -1.99
IKS1P47042 ARR2YPR200C 393 nt2.65□□□□□ -1.99
IKS1P47042 SPE1YKL184W 1401 nt2.65□□□□□ -1.99
IKS1P47042 DYN1YKR054C 12279 nt2.65□□□□□ -1.99
IKS1P47042 CHS3YBR023C 3498 nt2.65□□□□□ -1.99
IKS1P47042 RPS26BYER131W 360 nt2.64□□□□□ -1.99
IKS1P47042 BET3YKR068C 582 nt2.64□□□□□ -1.99
IKS1P47042 YLR230WYLR230W 306 nt2.64□□□□□ -1.99
IKS1P47042 YLR302CYLR302C 363 nt2.64□□□□□ -1.99
IKS1P47042 PKR1YMR123W 369 nt2.64□□□□□ -1.99
IKS1P47042 CMC2YBL059C-A 330 nt2.64□□□□□ -1.99
IKS1P47042 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt2.64□□□□□ -1.99
IKS1P47042 UBP14YBR058C 2346 nt2.64□□□□□ -1.99
IKS1P47042 PRP8YHR165C 7242 nt2.63□□□□□ -1.99
IKS1P47042 FRE2YKL220C 2136 nt2.63□□□□□ -1.99
IKS1P47042 DUF1YOL087C 3351 nt2.63□□□□□ -1.99
IKS1P47042 MOT1YPL082C 5604 nt2.63□□□□□ -1.99
IKS1P47042 YDR269CYDR269C 324 nt2.63□□□□□ -1.99
IKS1P47042 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.63□□□□□ -1.99
IKS1P47042 NOP15YNL110C 663 nt2.63□□□□□ -1.99
IKS1P47042 NGL1YOL042W 1092 nt2.63□□□□□ -1.99
IKS1P47042 ALY1YKR021W 2748 nt2.63□□□□□ -1.99
IKS1P47042 ARK1YNL020C 1917 nt2.62□□□□□ -1.99
IKS1P47042 HEH2YDR458C 1992 nt2.62□□□□□ -1.99
IKS1P47042 RSN1YMR266W 2862 nt2.62□□□□□ -1.99
IKS1P47042 YER038W-AYER038W-A 381 nt2.62□□□□□ -1.99
IKS1P47042 YER087C-AYER087C-A 552 nt2.62□□□□□ -1.99
IKS1P47042 YER135CYER135C 393 nt2.62□□□□□ -1.99
IKS1P47042 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt2.62□□□□□ -1.99
IKS1P47042 YHR138CYHR138C 345 nt2.62□□□□□ -1.99
IKS1P47042 YIL012WYIL012W 342 nt2.62□□□□□ -1.99
IKS1P47042 TMA10YLR327C 261 nt2.62□□□□□ -1.99
IKS1P47042 HHT2YNL031C 411 nt2.62□□□□□ -1.99
IKS1P47042 YOL159CYOL159C 516 nt2.62□□□□□ -1.99
IKS1P47042 YPL276WYPL276W 438 nt2.62□□□□□ -1.99
IKS1P47042 ECM21YBL101C 3354 nt2.62□□□□□ -1.99
IKS1P47042 VPS3YDR495C 3036 nt2.62□□□□□ -1.99
IKS1P47042 GCD6YDR211W 2139 nt2.62□□□□□ -1.99
IKS1P47042 SRC1YML034W 2505 nt2.62□□□□□ -1.99
IKS1P47042 SOK1YDR006C 2706 nt2.62□□□□□ -1.99
IKS1P47042 VPS64YDR200C 1815 nt2.61□□□□□ -1.99
IKS1P47042 TOM70YNL121C 1854 nt2.61□□□□□ -1.99
IKS1P47042 YER006C-AYER006C-A 318 nt2.61□□□□□ -1.99
IKS1P47042 TCD1YHR003C 1290 nt2.61□□□□□ -1.99
IKS1P47042 YHR125WYHR125W 306 nt2.61□□□□□ -1.99
IKS1P47042 HEM4YOR278W 828 nt2.61□□□□□ -1.99
IKS1P47042 YPL034WYPL034W 498 nt2.61□□□□□ -1.99
IKS1P47042 CDC55YGL190C 1581 nt2.61□□□□□ -1.99
IKS1P47042 SPP382YLR424W 2127 nt2.6□□□□□ -1.99
IKS1P47042 MDM1YML104C 3384 nt2.6□□□□□ -1.99
IKS1P47042 PUF6YDR496C 1971 nt2.6□□□□□ -1.99
IKS1P47042 PAU23YLR037C 375 nt2.6□□□□□ -1.99
IKS1P47042 RPL6AYML073C 531 nt2.6□□□□□ -1.99
IKS1P47042 YOR248WYOR248W 303 nt2.6□□□□□ -1.99
IKS1P47042 PMR1YGL167C 2853 nt2.6□□□□□ -1.99
IKS1P47042 RAX2YLR084C 3663 nt2.6□□□□□ -1.99
IKS1P47042 GLC7YER133W 939 nt2.59□□□□□ -1.99
IKS1P47042 ERP6YGL002W 651 nt2.59□□□□□ -1.99
IKS1P47042 TPM2YIL138C 486 nt2.59□□□□□ -1.99
IKS1P47042 MRP49YKL167C 414 nt2.59□□□□□ -1.99
IKS1P47042 CMS1YLR003C 876 nt2.59□□□□□ -1.99
IKS1P47042 LSM2YBL026W 288 nt2.59□□□□□ -1.99
IKS1P47042 SSN8YNL025C 972 nt2.59□□□□□ -1.99
IKS1P47042 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.59□□□□□ -2
IKS1P47042 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.59□□□□□ -2
IKS1P47042 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.59□□□□□ -2
IKS1P47042 AVT2YEL064C 1443 nt2.59□□□□□ -2
IKS1P47042 ITC1YGL133W 3795 nt2.58□□□□□ -2
IKS1P47042 RIX1YHR197W 2292 nt2.58□□□□□ -2
IKS1P47042 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.58□□□□□ -2
IKS1P47042 YHL005CYHL005C 393 nt2.58□□□□□ -2
IKS1P47042 MRPL38YKL170W 417 nt2.58□□□□□ -2
IKS1P47042 YLR269CYLR269C 351 nt2.58□□□□□ -2
IKS1P47042 YOL150CYOL150C 312 nt2.58□□□□□ -2
IKS1P47042 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.58□□□□□ -2
IKS1P47042 ALG14YBR070C 714 nt2.58□□□□□ -2
IKS1P47042 ATG13YPR185W 2217 nt2.58□□□□□ -2
IKS1P47042 EXO84YBR102C 2262 nt2.58□□□□□ -2
IKS1P47042 RUD3YOR216C 1455 nt2.58□□□□□ -2
IKS1P47042 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.57□□□□□ -2
IKS1P47042 NMD2YHR077C 3270 nt2.57□□□□□ -2
IKS1P47042 MES1YGR264C 2256 nt2.57□□□□□ -2
IKS1P47042 TFC4YGR047C 3078 nt2.57□□□□□ -2
IKS1P47042 UTP13YLR222C 2454 nt2.57□□□□□ -2
IKS1P47042 SMB1YER029C 591 nt2.57□□□□□ -2
IKS1P47042 PRE4YFR050C 801 nt2.57□□□□□ -2
IKS1P47042 YPS5YGL259W 498 nt2.57□□□□□ -2
IKS1P47042 CRG1YHR209W 876 nt2.57□□□□□ -2
IKS1P47042 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.57□□□□□ -2
IKS1P47042 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.57□□□□□ -2
IKS1P47042 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.57□□□□□ -2
IKS1P47042 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.57□□□□□ -2
IKS1P47042 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.57□□□□□ -2
IKS1P47042 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.57□□□□□ -2
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