Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UTRNP46939 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
UTRNP46939 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UTRNP46939 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UTRNP46939 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UTRNP46939 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UTRNP46939 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UTRNP46939 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UTRNP46939 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UTRNP46939 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UTRNP46939 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UTRNP46939 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UTRNP46939 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UTRNP46939 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UTRNP46939 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UTRNP46939 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UTRNP46939 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UTRNP46939 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UTRNP46939 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UTRNP46939 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UTRNP46939 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UTRNP46939 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UTRNP46939 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UTRNP46939 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UTRNP46939 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UTRNP46939 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UTRNP46939 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UTRNP46939 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UTRNP46939 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UTRNP46939 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UTRNP46939 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UTRNP46939 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UTRNP46939 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UTRNP46939 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UTRNP46939 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UTRNP46939 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UTRNP46939 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
UTRNP46939 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UTRNP46939 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UTRNP46939 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UTRNP46939 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UTRNP46939 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UTRNP46939 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
UTRNP46939 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UTRNP46939 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UTRNP46939 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UTRNP46939 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UTRNP46939 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UTRNP46939 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UTRNP46939 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UTRNP46939 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UTRNP46939 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
UTRNP46939 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UTRNP46939 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UTRNP46939 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UTRNP46939 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
UTRNP46939 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UTRNP46939 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UTRNP46939 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UTRNP46939 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UTRNP46939 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UTRNP46939 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UTRNP46939 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UTRNP46939 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UTRNP46939 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UTRNP46939 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UTRNP46939 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UTRNP46939 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UTRNP46939 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UTRNP46939 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UTRNP46939 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UTRNP46939 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
UTRNP46939 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
UTRNP46939 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UTRNP46939 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
UTRNP46939 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
UTRNP46939 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UTRNP46939 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UTRNP46939 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UTRNP46939 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UTRNP46939 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UTRNP46939 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UTRNP46939 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UTRNP46939 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
UTRNP46939 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UTRNP46939 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UTRNP46939 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UTRNP46939 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UTRNP46939 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
UTRNP46939 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UTRNP46939 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UTRNP46939 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UTRNP46939 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UTRNP46939 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UTRNP46939 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UTRNP46939 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
UTRNP46939 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UTRNP46939 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UTRNP46939 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UTRNP46939 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms