Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP2P46087 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP2P46087 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP2P46087 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP2P46087 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP2P46087 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP2P46087 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOP2P46087 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOP2P46087 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOP2P46087 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOP2P46087 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOP2P46087 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOP2P46087 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOP2P46087 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOP2P46087 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOP2P46087 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOP2P46087 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOP2P46087 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOP2P46087 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NOP2P46087 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOP2P46087 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOP2P46087 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOP2P46087 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOP2P46087 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOP2P46087 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOP2P46087 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOP2P46087 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOP2P46087 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOP2P46087 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOP2P46087 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOP2P46087 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NOP2P46087 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOP2P46087 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOP2P46087 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOP2P46087 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOP2P46087 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOP2P46087 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOP2P46087 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOP2P46087 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOP2P46087 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOP2P46087 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOP2P46087 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOP2P46087 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOP2P46087 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOP2P46087 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOP2P46087 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOP2P46087 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOP2P46087 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOP2P46087 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NOP2P46087 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOP2P46087 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOP2P46087 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOP2P46087 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOP2P46087 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOP2P46087 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOP2P46087 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOP2P46087 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOP2P46087 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOP2P46087 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOP2P46087 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOP2P46087 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOP2P46087 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOP2P46087 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOP2P46087 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NOP2P46087 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NOP2P46087 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOP2P46087 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOP2P46087 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOP2P46087 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOP2P46087 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOP2P46087 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOP2P46087 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOP2P46087 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOP2P46087 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOP2P46087 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOP2P46087 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOP2P46087 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOP2P46087 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOP2P46087 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOP2P46087 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOP2P46087 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOP2P46087 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOP2P46087 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOP2P46087 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOP2P46087 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NOP2P46087 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOP2P46087 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOP2P46087 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NOP2P46087 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NOP2P46087 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOP2P46087 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOP2P46087 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOP2P46087 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOP2P46087 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOP2P46087 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOP2P46087 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOP2P46087 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOP2P46087 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOP2P46087 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NOP2P46087 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms