Protein–RNA interactions for Protein: P43353

ALDH3B1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH3B1P43353 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALDH3B1P43353 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALDH3B1P43353 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALDH3B1P43353 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALDH3B1P43353 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALDH3B1P43353 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ALDH3B1P43353 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALDH3B1P43353 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ALDH3B1P43353 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALDH3B1P43353 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALDH3B1P43353 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms