Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms