Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH11P35749 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH11P35749 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH11P35749 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH11P35749 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH11P35749 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH11P35749 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH11P35749 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH11P35749 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH11P35749 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH11P35749 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH11P35749 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH11P35749 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH11P35749 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH11P35749 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYH11P35749 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYH11P35749 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYH11P35749 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYH11P35749 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYH11P35749 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYH11P35749 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYH11P35749 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYH11P35749 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYH11P35749 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MYH11P35749 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYH11P35749 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYH11P35749 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYH11P35749 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYH11P35749 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYH11P35749 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYH11P35749 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYH11P35749 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYH11P35749 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYH11P35749 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYH11P35749 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYH11P35749 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYH11P35749 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYH11P35749 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYH11P35749 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYH11P35749 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYH11P35749 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MYH11P35749 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYH11P35749 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYH11P35749 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYH11P35749 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYH11P35749 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYH11P35749 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MYH11P35749 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYH11P35749 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYH11P35749 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYH11P35749 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYH11P35749 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYH11P35749 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYH11P35749 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MYH11P35749 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYH11P35749 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYH11P35749 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYH11P35749 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MYH11P35749 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYH11P35749 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYH11P35749 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH11P35749 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH11P35749 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH11P35749 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH11P35749 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH11P35749 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH11P35749 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH11P35749 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH11P35749 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH11P35749 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH11P35749 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH11P35749 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH11P35749 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH11P35749 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH11P35749 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH11P35749 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH11P35749 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH11P35749 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH11P35749 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH11P35749 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH11P35749 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH11P35749 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH11P35749 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH11P35749 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH11P35749 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH11P35749 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH11P35749 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYH11P35749 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYH11P35749 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYH11P35749 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYH11P35749 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYH11P35749 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYH11P35749 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYH11P35749 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYH11P35749 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYH11P35749 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYH11P35749 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYH11P35749 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYH11P35749 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MYH11P35749 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms