Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms