Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA6P31267 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA6P31267 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA6P31267 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA6P31267 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA6P31267 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA6P31267 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA6P31267 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms