Protein–RNA interactions for Protein: P30301

MIP, Lens fiber major intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPP30301 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MIPP30301 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MIPP30301 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MIPP30301 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MIPP30301 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MIPP30301 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MIPP30301 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MIPP30301 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MIPP30301 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MIPP30301 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MIPP30301 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MIPP30301 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MIPP30301 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MIPP30301 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MIPP30301 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MIPP30301 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MIPP30301 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MIPP30301 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MIPP30301 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MIPP30301 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MIPP30301 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MIPP30301 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MIPP30301 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MIPP30301 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MIPP30301 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MIPP30301 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MIPP30301 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MIPP30301 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MIPP30301 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MIPP30301 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MIPP30301 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MIPP30301 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MIPP30301 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MIPP30301 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MIPP30301 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MIPP30301 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MIPP30301 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MIPP30301 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MIPP30301 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MIPP30301 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MIPP30301 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MIPP30301 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MIPP30301 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MIPP30301 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MIPP30301 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MIPP30301 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MIPP30301 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MIPP30301 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MIPP30301 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MIPP30301 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MIPP30301 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MIPP30301 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MIPP30301 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIPP30301 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIPP30301 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIPP30301 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIPP30301 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIPP30301 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIPP30301 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIPP30301 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIPP30301 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MIPP30301 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIPP30301 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIPP30301 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIPP30301 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIPP30301 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIPP30301 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIPP30301 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIPP30301 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIPP30301 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MIPP30301 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIPP30301 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIPP30301 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIPP30301 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPP30301 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPP30301 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPP30301 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPP30301 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPP30301 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPP30301 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPP30301 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPP30301 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPP30301 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPP30301 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPP30301 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPP30301 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPP30301 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPP30301 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPP30301 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPP30301 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPP30301 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPP30301 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPP30301 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPP30301 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPP30301 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPP30301 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPP30301 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MIPP30301 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MIPP30301 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MIPP30301 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms