Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCKSP29966 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms