Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms