Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD34P28906 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD34P28906 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD34P28906 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD34P28906 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD34P28906 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD34P28906 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD34P28906 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD34P28906 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD34P28906 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD34P28906 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD34P28906 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD34P28906 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD34P28906 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD34P28906 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD34P28906 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD34P28906 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD34P28906 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD34P28906 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD34P28906 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD34P28906 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD34P28906 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD34P28906 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD34P28906 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD34P28906 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD34P28906 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD34P28906 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD34P28906 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD34P28906 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD34P28906 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD34P28906 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD34P28906 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD34P28906 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD34P28906 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD34P28906 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD34P28906 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD34P28906 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD34P28906 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD34P28906 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD34P28906 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD34P28906 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD34P28906 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD34P28906 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD34P28906 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD34P28906 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CD34P28906 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD34P28906 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD34P28906 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD34P28906 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD34P28906 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CD34P28906 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD34P28906 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD34P28906 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD34P28906 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD34P28906 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD34P28906 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD34P28906 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD34P28906 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD34P28906 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD34P28906 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD34P28906 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD34P28906 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD34P28906 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD34P28906 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD34P28906 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD34P28906 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD34P28906 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD34P28906 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD34P28906 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD34P28906 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD34P28906 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD34P28906 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD34P28906 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD34P28906 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD34P28906 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD34P28906 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD34P28906 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD34P28906 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD34P28906 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD34P28906 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD34P28906 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD34P28906 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD34P28906 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD34P28906 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD34P28906 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD34P28906 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD34P28906 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD34P28906 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD34P28906 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD34P28906 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD34P28906 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CD34P28906 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD34P28906 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD34P28906 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD34P28906 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD34P28906 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD34P28906 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CD34P28906 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD34P28906 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD34P28906 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms