Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMO2P25791 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMO2P25791 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMO2P25791 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO2P25791 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO2P25791 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO2P25791 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO2P25791 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO2P25791 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO2P25791 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO2P25791 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO2P25791 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO2P25791 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO2P25791 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO2P25791 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO2P25791 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO2P25791 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO2P25791 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO2P25791 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO2P25791 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO2P25791 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO2P25791 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO2P25791 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO2P25791 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO2P25791 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO2P25791 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO2P25791 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO2P25791 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO2P25791 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO2P25791 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO2P25791 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO2P25791 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO2P25791 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO2P25791 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO2P25791 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO2P25791 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO2P25791 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO2P25791 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO2P25791 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO2P25791 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO2P25791 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO2P25791 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO2P25791 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO2P25791 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO2P25791 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO2P25791 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO2P25791 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO2P25791 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO2P25791 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO2P25791 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO2P25791 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO2P25791 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO2P25791 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO2P25791 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO2P25791 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO2P25791 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO2P25791 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO2P25791 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO2P25791 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO2P25791 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO2P25791 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO2P25791 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO2P25791 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMO2P25791 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMO2P25791 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMO2P25791 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMO2P25791 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMO2P25791 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMO2P25791 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMO2P25791 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMO2P25791 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LMO2P25791 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMO2P25791 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMO2P25791 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMO2P25791 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LMO2P25791 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMO2P25791 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMO2P25791 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMO2P25791 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO2P25791 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO2P25791 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO2P25791 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO2P25791 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO2P25791 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO2P25791 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO2P25791 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO2P25791 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO2P25791 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO2P25791 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO2P25791 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO2P25791 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO2P25791 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO2P25791 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO2P25791 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO2P25791 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO2P25791 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO2P25791 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO2P25791 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO2P25791 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO2P25791 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms