Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB1P14653 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms