Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOP1P11387 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOP1P11387 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOP1P11387 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOP1P11387 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOP1P11387 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOP1P11387 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TOP1P11387 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOP1P11387 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOP1P11387 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOP1P11387 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOP1P11387 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOP1P11387 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TOP1P11387 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOP1P11387 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOP1P11387 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOP1P11387 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOP1P11387 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TOP1P11387 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TOP1P11387 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOP1P11387 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOP1P11387 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOP1P11387 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOP1P11387 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOP1P11387 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOP1P11387 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TOP1P11387 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TOP1P11387 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TOP1P11387 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOP1P11387 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOP1P11387 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOP1P11387 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOP1P11387 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOP1P11387 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOP1P11387 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOP1P11387 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOP1P11387 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOP1P11387 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOP1P11387 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOP1P11387 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP1P11387 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP1P11387 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP1P11387 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP1P11387 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP1P11387 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP1P11387 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP1P11387 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP1P11387 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP1P11387 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP1P11387 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP1P11387 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP1P11387 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP1P11387 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP1P11387 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP1P11387 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP1P11387 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP1P11387 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP1P11387 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP1P11387 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP1P11387 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP1P11387 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP1P11387 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP1P11387 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP1P11387 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP1P11387 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP1P11387 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP1P11387 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP1P11387 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP1P11387 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP1P11387 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP1P11387 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP1P11387 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP1P11387 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP1P11387 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP1P11387 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP1P11387 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP1P11387 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP1P11387 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP1P11387 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP1P11387 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP1P11387 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP1P11387 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP1P11387 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP1P11387 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP1P11387 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP1P11387 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP1P11387 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP1P11387 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP1P11387 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP1P11387 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP1P11387 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP1P11387 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP1P11387 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP1P11387 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP1P11387 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP1P11387 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP1P11387 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP1P11387 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP1P11387 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP1P11387 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms