Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGAMP11215 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms