Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GLI3P10071 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GLI3P10071 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GLI3P10071 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GLI3P10071 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GLI3P10071 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GLI3P10071 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GLI3P10071 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GLI3P10071 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GLI3P10071 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GLI3P10071 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GLI3P10071 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GLI3P10071 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GLI3P10071 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GLI3P10071 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GLI3P10071 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GLI3P10071 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GLI3P10071 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
GLI3P10071 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GLI3P10071 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GLI3P10071 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GLI3P10071 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GLI3P10071 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GLI3P10071 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GLI3P10071 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GLI3P10071 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GLI3P10071 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GLI3P10071 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GLI3P10071 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GLI3P10071 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GLI3P10071 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GLI3P10071 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GLI3P10071 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GLI3P10071 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GLI3P10071 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GLI3P10071 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GLI3P10071 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI3P10071 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI3P10071 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI3P10071 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI3P10071 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI3P10071 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI3P10071 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI3P10071 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI3P10071 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI3P10071 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI3P10071 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI3P10071 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI3P10071 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI3P10071 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI3P10071 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI3P10071 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI3P10071 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI3P10071 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI3P10071 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI3P10071 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI3P10071 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI3P10071 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI3P10071 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI3P10071 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI3P10071 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI3P10071 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI3P10071 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI3P10071 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI3P10071 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI3P10071 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI3P10071 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI3P10071 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI3P10071 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI3P10071 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI3P10071 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI3P10071 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI3P10071 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI3P10071 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI3P10071 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI3P10071 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI3P10071 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI3P10071 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI3P10071 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI3P10071 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI3P10071 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI3P10071 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI3P10071 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GLI3P10071 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GLI3P10071 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GLI3P10071 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GLI3P10071 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GLI3P10071 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GLI3P10071 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GLI3P10071 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLI3P10071 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLI3P10071 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLI3P10071 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLI3P10071 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLI3P10071 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLI3P10071 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLI3P10071 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GLI3P10071 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLI3P10071 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLI3P10071 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms