Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2AF1L5P0DN76 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms