Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms