Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF3P09919 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF3P09919 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF3P09919 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF3P09919 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF3P09919 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF3P09919 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF3P09919 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF3P09919 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF3P09919 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF3P09919 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF3P09919 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF3P09919 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF3P09919 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF3P09919 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF3P09919 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF3P09919 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF3P09919 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3P09919 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3P09919 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3P09919 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3P09919 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3P09919 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3P09919 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3P09919 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3P09919 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3P09919 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3P09919 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3P09919 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3P09919 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3P09919 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3P09919 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3P09919 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3P09919 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3P09919 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3P09919 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3P09919 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3P09919 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3P09919 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3P09919 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3P09919 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3P09919 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3P09919 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3P09919 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3P09919 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3P09919 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3P09919 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3P09919 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3P09919 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3P09919 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3P09919 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3P09919 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3P09919 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3P09919 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3P09919 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3P09919 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3P09919 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3P09919 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3P09919 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3P09919 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3P09919 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3P09919 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3P09919 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3P09919 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3P09919 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3P09919 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3P09919 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3P09919 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3P09919 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3P09919 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3P09919 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3P09919 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3P09919 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3P09919 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3P09919 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3P09919 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3P09919 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3P09919 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3P09919 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3P09919 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3P09919 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3P09919 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3P09919 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3P09919 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3P09919 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3P09919 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3P09919 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3P09919 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3P09919 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3P09919 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3P09919 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3P09919 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3P09919 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3P09919 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3P09919 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3P09919 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3P09919 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3P09919 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3P09919 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3P09919 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms