Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB1P08034 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB1P08034 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB1P08034 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB1P08034 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB1P08034 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB1P08034 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB1P08034 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB1P08034 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB1P08034 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB1P08034 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJB1P08034 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJB1P08034 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB1P08034 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB1P08034 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB1P08034 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB1P08034 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB1P08034 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB1P08034 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB1P08034 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB1P08034 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB1P08034 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB1P08034 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB1P08034 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB1P08034 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB1P08034 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB1P08034 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB1P08034 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB1P08034 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB1P08034 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB1P08034 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB1P08034 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB1P08034 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB1P08034 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB1P08034 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB1P08034 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB1P08034 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB1P08034 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB1P08034 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB1P08034 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB1P08034 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB1P08034 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB1P08034 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB1P08034 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB1P08034 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB1P08034 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB1P08034 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB1P08034 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB1P08034 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB1P08034 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB1P08034 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB1P08034 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB1P08034 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB1P08034 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB1P08034 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB1P08034 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB1P08034 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB1P08034 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB1P08034 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB1P08034 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB1P08034 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB1P08034 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB1P08034 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB1P08034 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB1P08034 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB1P08034 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB1P08034 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB1P08034 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB1P08034 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB1P08034 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB1P08034 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB1P08034 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB1P08034 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB1P08034 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB1P08034 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB1P08034 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB1P08034 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB1P08034 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB1P08034 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB1P08034 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB1P08034 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB1P08034 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB1P08034 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB1P08034 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB1P08034 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB1P08034 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB1P08034 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB1P08034 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB1P08034 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB1P08034 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB1P08034 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB1P08034 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB1P08034 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB1P08034 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB1P08034 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB1P08034 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB1P08034 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB1P08034 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB1P08034 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB1P08034 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms