Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPBP07199 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPBP07199 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPBP07199 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPBP07199 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPBP07199 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPBP07199 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPBP07199 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPBP07199 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPBP07199 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPBP07199 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPBP07199 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPBP07199 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPBP07199 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPBP07199 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPBP07199 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPBP07199 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPBP07199 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPBP07199 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPBP07199 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPBP07199 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPBP07199 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPBP07199 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPBP07199 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPBP07199 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPBP07199 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPBP07199 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPBP07199 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPBP07199 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPBP07199 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPBP07199 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPBP07199 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPBP07199 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPBP07199 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPBP07199 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPBP07199 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPBP07199 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPBP07199 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPBP07199 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPBP07199 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPBP07199 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CENPBP07199 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CENPBP07199 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CENPBP07199 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CENPBP07199 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CENPBP07199 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CENPBP07199 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CENPBP07199 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CENPBP07199 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CENPBP07199 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CENPBP07199 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CENPBP07199 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CENPBP07199 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CENPBP07199 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CENPBP07199 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPBP07199 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPBP07199 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPBP07199 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPBP07199 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPBP07199 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPBP07199 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPBP07199 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPBP07199 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPBP07199 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPBP07199 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPBP07199 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPBP07199 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPBP07199 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPBP07199 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPBP07199 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPBP07199 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPBP07199 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPBP07199 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPBP07199 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPBP07199 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPBP07199 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPBP07199 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPBP07199 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPBP07199 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPBP07199 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPBP07199 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPBP07199 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPBP07199 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPBP07199 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPBP07199 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPBP07199 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPBP07199 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPBP07199 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPBP07199 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPBP07199 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPBP07199 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPBP07199 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPBP07199 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPBP07199 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPBP07199 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPBP07199 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPBP07199 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPBP07199 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPBP07199 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPBP07199 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms