Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAVP06756 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGAVP06756 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGAVP06756 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGAVP06756 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGAVP06756 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGAVP06756 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGAVP06756 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGAVP06756 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAVP06756 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAVP06756 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAVP06756 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ITGAVP06756 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAVP06756 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAVP06756 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ITGAVP06756 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAVP06756 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAVP06756 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAVP06756 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAVP06756 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAVP06756 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAVP06756 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAVP06756 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAVP06756 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAVP06756 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAVP06756 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAVP06756 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAVP06756 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAVP06756 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAVP06756 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAVP06756 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAVP06756 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAVP06756 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAVP06756 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAVP06756 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAVP06756 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ITGAVP06756 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAVP06756 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAVP06756 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAVP06756 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAVP06756 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAVP06756 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ITGAVP06756 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms