Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR3DP05423 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR3DP05423 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR3DP05423 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR3DP05423 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR3DP05423 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR3DP05423 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR3DP05423 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR3DP05423 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR3DP05423 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR3DP05423 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR3DP05423 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR3DP05423 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR3DP05423 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR3DP05423 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR3DP05423 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR3DP05423 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR3DP05423 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR3DP05423 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR3DP05423 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR3DP05423 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR3DP05423 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR3DP05423 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR3DP05423 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR3DP05423 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR3DP05423 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR3DP05423 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR3DP05423 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR3DP05423 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR3DP05423 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR3DP05423 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR3DP05423 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR3DP05423 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms