Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms