Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TYMSP04818 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TYMSP04818 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMSP04818 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMSP04818 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMSP04818 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMSP04818 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMSP04818 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMSP04818 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMSP04818 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMSP04818 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMSP04818 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMSP04818 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMSP04818 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMSP04818 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMSP04818 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMSP04818 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMSP04818 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMSP04818 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMSP04818 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMSP04818 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMSP04818 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMSP04818 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMSP04818 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMSP04818 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMSP04818 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMSP04818 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMSP04818 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMSP04818 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMSP04818 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMSP04818 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMSP04818 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMSP04818 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMSP04818 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMSP04818 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMSP04818 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMSP04818 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMSP04818 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMSP04818 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMSP04818 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMSP04818 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMSP04818 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMSP04818 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMSP04818 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMSP04818 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMSP04818 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMSP04818 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMSP04818 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMSP04818 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMSP04818 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMSP04818 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMSP04818 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMSP04818 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMSP04818 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMSP04818 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMSP04818 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMSP04818 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMSP04818 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMSP04818 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMSP04818 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMSP04818 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMSP04818 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMSP04818 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMSP04818 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMSP04818 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMSP04818 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMSP04818 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMSP04818 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMSP04818 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMSP04818 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMSP04818 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMSP04818 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMSP04818 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMSP04818 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMSP04818 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMSP04818 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMSP04818 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMSP04818 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMSP04818 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMSP04818 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMSP04818 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMSP04818 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMSP04818 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMSP04818 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMSP04818 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMSP04818 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMSP04818 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMSP04818 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TYMSP04818 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TYMSP04818 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TYMSP04818 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TYMSP04818 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TYMSP04818 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TYMSP04818 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TYMSP04818 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TYMSP04818 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TYMSP04818 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TYMSP04818 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TYMSP04818 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TYMSP04818 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms