Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINC1P01008 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINC1P01008 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINC1P01008 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINC1P01008 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINC1P01008 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINC1P01008 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINC1P01008 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINC1P01008 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINC1P01008 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINC1P01008 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINC1P01008 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINC1P01008 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINC1P01008 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINC1P01008 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINC1P01008 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINC1P01008 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINC1P01008 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINC1P01008 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINC1P01008 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINC1P01008 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINC1P01008 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINC1P01008 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINC1P01008 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINC1P01008 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms