Protein–RNA interactions for Protein: P00734

F2, Prothrombin, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2P00734 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
F2P00734 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
F2P00734 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
F2P00734 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
F2P00734 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
F2P00734 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
F2P00734 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
F2P00734 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
F2P00734 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
F2P00734 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
F2P00734 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
F2P00734 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
F2P00734 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
F2P00734 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
F2P00734 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
F2P00734 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
F2P00734 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
F2P00734 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
F2P00734 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
F2P00734 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
F2P00734 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
F2P00734 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
F2P00734 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
F2P00734 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
F2P00734 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F2P00734 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
F2P00734 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F2P00734 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
F2P00734 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
F2P00734 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
F2P00734 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F2P00734 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F2P00734 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F2P00734 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F2P00734 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F2P00734 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F2P00734 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F2P00734 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F2P00734 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F2P00734 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F2P00734 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F2P00734 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F2P00734 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F2P00734 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F2P00734 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
F2P00734 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F2P00734 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F2P00734 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F2P00734 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F2P00734 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F2P00734 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F2P00734 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F2P00734 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F2P00734 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
F2P00734 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
F2P00734 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
F2P00734 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
F2P00734 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
F2P00734 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
F2P00734 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
F2P00734 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
F2P00734 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
F2P00734 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
F2P00734 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
F2P00734 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
F2P00734 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
F2P00734 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
F2P00734 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F2P00734 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
F2P00734 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
F2P00734 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F2P00734 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F2P00734 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
F2P00734 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F2P00734 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
F2P00734 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
F2P00734 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F2P00734 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
F2P00734 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
F2P00734 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F2P00734 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
F2P00734 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
F2P00734 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
F2P00734 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
F2P00734 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
F2P00734 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
F2P00734 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
F2P00734 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
F2P00734 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
F2P00734 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
F2P00734 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
F2P00734 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
F2P00734 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
F2P00734 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
F2P00734 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
F2P00734 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
F2P00734 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
F2P00734 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
F2P00734 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
F2P00734 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms