Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LCA5LO95447 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LCA5LO95447 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LCA5LO95447 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LCA5LO95447 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LCA5LO95447 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms