Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms