Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSCO60682 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSCO60682 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSCO60682 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSCO60682 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSCO60682 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSCO60682 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSCO60682 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MSCO60682 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSCO60682 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSCO60682 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSCO60682 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSCO60682 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSCO60682 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSCO60682 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSCO60682 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSCO60682 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSCO60682 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSCO60682 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSCO60682 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MSCO60682 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSCO60682 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSCO60682 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSCO60682 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MSCO60682 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSCO60682 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSCO60682 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSCO60682 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSCO60682 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSCO60682 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSCO60682 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSCO60682 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSCO60682 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSCO60682 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSCO60682 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MSCO60682 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSCO60682 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSCO60682 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSCO60682 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSCO60682 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSCO60682 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSCO60682 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSCO60682 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSCO60682 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSCO60682 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSCO60682 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSCO60682 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSCO60682 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSCO60682 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSCO60682 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSCO60682 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MSCO60682 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSCO60682 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSCO60682 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MSCO60682 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MSCO60682 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSCO60682 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSCO60682 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSCO60682 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSCO60682 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSCO60682 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSCO60682 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSCO60682 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSCO60682 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSCO60682 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MSCO60682 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSCO60682 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSCO60682 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSCO60682 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSCO60682 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSCO60682 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSCO60682 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSCO60682 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSCO60682 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSCO60682 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSCO60682 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSCO60682 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSCO60682 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MSCO60682 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSCO60682 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSCO60682 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSCO60682 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSCO60682 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSCO60682 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSCO60682 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSCO60682 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSCO60682 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSCO60682 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSCO60682 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSCO60682 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSCO60682 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSCO60682 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSCO60682 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSCO60682 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSCO60682 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSCO60682 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSCO60682 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSCO60682 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSCO60682 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSCO60682 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms