Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC32.83■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.79■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
KIAA0556O60303 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms