Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCO2O43819 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCO2O43819 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCO2O43819 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SCO2O43819 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCO2O43819 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCO2O43819 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCO2O43819 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCO2O43819 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCO2O43819 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCO2O43819 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCO2O43819 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCO2O43819 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCO2O43819 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCO2O43819 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCO2O43819 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SCO2O43819 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCO2O43819 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCO2O43819 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCO2O43819 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCO2O43819 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCO2O43819 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCO2O43819 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCO2O43819 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCO2O43819 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCO2O43819 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCO2O43819 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCO2O43819 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCO2O43819 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCO2O43819 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCO2O43819 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCO2O43819 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCO2O43819 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCO2O43819 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCO2O43819 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCO2O43819 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCO2O43819 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCO2O43819 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCO2O43819 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCO2O43819 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCO2O43819 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCO2O43819 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCO2O43819 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCO2O43819 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCO2O43819 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCO2O43819 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCO2O43819 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCO2O43819 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCO2O43819 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCO2O43819 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCO2O43819 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCO2O43819 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCO2O43819 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SCO2O43819 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCO2O43819 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCO2O43819 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SCO2O43819 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SCO2O43819 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCO2O43819 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCO2O43819 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCO2O43819 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCO2O43819 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCO2O43819 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCO2O43819 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCO2O43819 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCO2O43819 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCO2O43819 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCO2O43819 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCO2O43819 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCO2O43819 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCO2O43819 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCO2O43819 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCO2O43819 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCO2O43819 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCO2O43819 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCO2O43819 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCO2O43819 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCO2O43819 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCO2O43819 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCO2O43819 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCO2O43819 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCO2O43819 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCO2O43819 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCO2O43819 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCO2O43819 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCO2O43819 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCO2O43819 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCO2O43819 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCO2O43819 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCO2O43819 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCO2O43819 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCO2O43819 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCO2O43819 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCO2O43819 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCO2O43819 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCO2O43819 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCO2O43819 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCO2O43819 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SCO2O43819 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCO2O43819 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms