Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF14O43557 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF14O43557 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF14O43557 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF14O43557 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF14O43557 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF14O43557 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF14O43557 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF14O43557 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF14O43557 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF14O43557 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF14O43557 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF14O43557 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF14O43557 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF14O43557 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF14O43557 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF14O43557 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF14O43557 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF14O43557 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF14O43557 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF14O43557 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF14O43557 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF14O43557 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF14O43557 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF14O43557 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF14O43557 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF14O43557 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF14O43557 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TNFSF14O43557 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TNFSF14O43557 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TNFSF14O43557 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms