Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VGFO15240 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VGFO15240 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VGFO15240 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VGFO15240 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VGFO15240 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VGFO15240 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
VGFO15240 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VGFO15240 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VGFO15240 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VGFO15240 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VGFO15240 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
VGFO15240 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VGFO15240 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VGFO15240 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VGFO15240 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VGFO15240 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VGFO15240 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VGFO15240 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VGFO15240 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
VGFO15240 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
VGFO15240 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VGFO15240 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VGFO15240 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VGFO15240 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VGFO15240 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
VGFO15240 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VGFO15240 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
VGFO15240 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VGFO15240 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VGFO15240 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VGFO15240 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VGFO15240 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VGFO15240 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VGFO15240 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VGFO15240 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VGFO15240 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VGFO15240 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VGFO15240 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VGFO15240 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VGFO15240 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VGFO15240 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VGFO15240 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VGFO15240 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VGFO15240 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VGFO15240 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
VGFO15240 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VGFO15240 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VGFO15240 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VGFO15240 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VGFO15240 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
VGFO15240 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
VGFO15240 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VGFO15240 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VGFO15240 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VGFO15240 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VGFO15240 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
VGFO15240 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
VGFO15240 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
VGFO15240 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VGFO15240 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VGFO15240 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VGFO15240 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VGFO15240 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VGFO15240 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VGFO15240 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VGFO15240 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VGFO15240 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VGFO15240 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
VGFO15240 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VGFO15240 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VGFO15240 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VGFO15240 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VGFO15240 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
VGFO15240 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VGFO15240 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VGFO15240 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VGFO15240 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VGFO15240 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
VGFO15240 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
VGFO15240 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
VGFO15240 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VGFO15240 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VGFO15240 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
VGFO15240 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
VGFO15240 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VGFO15240 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VGFO15240 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
VGFO15240 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
VGFO15240 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VGFO15240 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VGFO15240 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VGFO15240 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VGFO15240 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
VGFO15240 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
VGFO15240 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VGFO15240 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VGFO15240 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
VGFO15240 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
VGFO15240 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms