Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F3O00716 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F3O00716 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F3O00716 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F3O00716 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F3O00716 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F3O00716 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F3O00716 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F3O00716 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F3O00716 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F3O00716 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F3O00716 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F3O00716 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F3O00716 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F3O00716 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F3O00716 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F3O00716 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F3O00716 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F3O00716 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F3O00716 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F3O00716 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F3O00716 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F3O00716 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F3O00716 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F3O00716 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F3O00716 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F3O00716 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F3O00716 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F3O00716 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F3O00716 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F3O00716 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F3O00716 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F3O00716 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F3O00716 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F3O00716 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F3O00716 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F3O00716 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F3O00716 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F3O00716 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F3O00716 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F3O00716 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F3O00716 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F3O00716 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F3O00716 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F3O00716 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F3O00716 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F3O00716 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F3O00716 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F3O00716 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F3O00716 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F3O00716 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F3O00716 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F3O00716 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F3O00716 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F3O00716 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F3O00716 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F3O00716 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F3O00716 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F3O00716 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F3O00716 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F3O00716 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F3O00716 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F3O00716 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F3O00716 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F3O00716 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F3O00716 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F3O00716 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F3O00716 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F3O00716 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F3O00716 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F3O00716 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F3O00716 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F3O00716 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F3O00716 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F3O00716 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F3O00716 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F3O00716 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F3O00716 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F3O00716 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F3O00716 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F3O00716 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F3O00716 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F3O00716 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F3O00716 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F3O00716 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F3O00716 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F3O00716 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F3O00716 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F3O00716 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F3O00716 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F3O00716 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F3O00716 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F3O00716 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F3O00716 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
E2F3O00716 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
E2F3O00716 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
E2F3O00716 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
E2F3O00716 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
E2F3O00716 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
E2F3O00716 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms