Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLIM4O00461 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLIM4O00461 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLIM4O00461 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLIM4O00461 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLIM4O00461 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLIM4O00461 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLIM4O00461 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLIM4O00461 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLIM4O00461 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLIM4O00461 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLIM4O00461 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLIM4O00461 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLIM4O00461 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms