Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GFRA2O00451 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GFRA2O00451 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GFRA2O00451 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GFRA2O00451 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GFRA2O00451 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GFRA2O00451 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GFRA2O00451 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GFRA2O00451 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GFRA2O00451 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GFRA2O00451 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GFRA2O00451 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GFRA2O00451 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GFRA2O00451 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GFRA2O00451 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GFRA2O00451 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GFRA2O00451 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GFRA2O00451 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GFRA2O00451 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GFRA2O00451 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GFRA2O00451 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms