Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms