Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms