Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DEV8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DEV8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DEV8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DEV8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DEV8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DEV8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DEV8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DEV8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DEV8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DEV8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DEV8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DEV8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DEV8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DEV8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DEV8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DEV8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DEV8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DEV8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DEV8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DEV8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DEV8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DEV8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DEV8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DEV8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DEV8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DEV8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DEV8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DEV8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DEV8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DEV8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DEV8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DEV8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DEV8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DEV8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DEV8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DEV8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DEV8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DEV8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DEV8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DEV8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DEV8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DEV8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DEV8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DEV8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DEV8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DEV8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DEV8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DEV8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DEV8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DEV8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DEV8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DEV8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DEV8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DEV8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DEV8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DEV8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DEV8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DEV8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DEV8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DEV8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DEV8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DEV8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DEV8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DEV8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DEV8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DEV8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DEV8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DEV8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DEV8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DEV8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DEV8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DEV8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DEV8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DEV8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DEV8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DEV8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DEV8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DEV8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DEV8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DEV8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DEV8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DEV8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DEV8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DEV8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DEV8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DEV8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DEV8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DEV8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DEV8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DEV8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DEV8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DEV8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DEV8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DEV8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DEV8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DEV8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DEV8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DEV8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DEV8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms