Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L5A8MUK1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms