Protein–RNA interactions for Protein: A8MU46

SMTNL1, Smoothelin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNL1A8MU46 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SMTNL1A8MU46 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SMTNL1A8MU46 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMTNL1A8MU46 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms