Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms